В исполнение приказа Федерального казначейства  от 1 октября 2012 года № 384 «О реорганизации управлений Федерального казначейства по субъектам Российской Федерации» и приказа Управления от 02 октября 2012 № 457 О реорганизации Управления Федерального казначейства по Кемеровской области» в качестве отделов к Управлению присоединено 7 отделений УФК по Кемеровской области: Отделение по г. Гурьевску УФК по Кемеровской области (отдел № 4), Отделение по г. Киселевску УФК по Кемеровской области (отдел № 6), Отделение по г. Ленинск-Кузнецкому УФК по Кемеровской области (отдел № 7), Отделение по г. Междуреченску УФК по Кемеровской области (отдел № 9). Отделение по г. Новокузнецку УФК по Кемеровской области (отдел № 11), Отделение по г. Прокопьевску УФК по Кемеровской области (отдел № 13), Отделение по г. Юрга УФК по Кемеровской области (отдел № 17).
Завершена оптимизация деятельности органов Федерального казначейства, в результате которой организационно-штатная структура Управления представлена 15 структурными подразделениями, консультантом по вопросам гражданской обороны, консультантом по вопросам мобилизационной подготовки и 23 отделами, созданными для осуществления функций Управления Федерального казначейства по Кемеровской области на соответствующей территории.