Во исполнение приказа Федерального казначейства от 26 сентября 2011 года № 414 «О реорганизации управлений Федерального казначейства по субъектам Российской Федерации»  и приказа Управления от 27 сентября 2011 №378 «О реорганизации Управления Федерального казначейства по Кемеровской области» с 1 января 2012 года  в качестве отделов к Управлению присоединено  6 отделений УФК по Кемеровской области: Отделение по Ижморскому району УФК по Кемеровской области (отдел № 10), Отделение по Крапивинскому району УФК по Кемеровской области (отдел № 14), Отделение по Тяжинскому району УФК по Кемеровской области (отдел № 20), Отделение по Тисульскому району УФК по Кемеровской области (отдел № 21), Отделение по Яйскому району УФК по Кемеровской области (отдел № 22), Отделение по Яшкинскому району УФК по Кемеровской области (отдел № 23).

Во исполнение приказа Федерального казначейства от 15 ноября 2011 года № 534 «О реорганизации Управления Федерального казначейства по Кемеровской области» и приказом Управления от 16 ноября 2011 года № 435 «О реорганизации Управления Федерального казначейства по Кемеровской области» с 1 февраля 2012 года в качестве отдела к Управлению присоединено Отделение по г. Кемерово УФК по Кемеровской области (отдел № 5).
В исполнение приказа Федерального казначейства от 20 января 2012 г. № 20 «О реорганизации управлений Федерального казначейства по субъектам Российской Федерации» и приказом Управления от 24 января 20121 года № 23 «О реорганизации Управления Федерального казначейства по Кемеровской области» со 2 апреля 2012 года в качестве отделов к Управлению присоединено 3 отделения УФК по Кемеровской области: Отделение по г. Березовский УФК по Кемеровской области (отдел № 3), Отделение по г. Таштаголу УФК по Кемеровской области (отдел № 15), Отделение по г. Топки УФК по Кемеровской области (отдел № 1).